额亦都说：“请恕俺直言。就齿序而言，代善居长，皇太极是弟辈，以武力论，代善独掌二旗，皇太极只领一旗；从德才说，代善为人宽厚，得到大家信赖。皇太极性格威厉，好权弄术，为人所畏惮。你看呢？”
以后，努尔哈赤又分别找了安费杨古、费英东、何和理、扈尔汉谈了“立储”问题，四人都倾向于代善。
万历四十四年（1616年，天命元年）正月初一日，努尔哈赤建立后金国，年号天命，并同时宣布代善代政，协助汗王管理政务。
不久的一天，努尔哈赤当着官妃、众子侄许诺说：“在朕百年之后，你们都得依靠代善负责照应呢！”
这是努尔哈赤公开将大妃乌喇氏及心肝幼子们托付给代善的表示，也就是预定代善日后将承袭汗位。
正如额亦都所说：代善性格宽柔，深孚众望，军功众多，权势甚大。自从协助努尔哈赤管理政务以后，凡努尔哈赤不在时，一些重大军机便先报告给他。
可是，代善只是一名武将，才气平庸，除了带兵打仗，冲锋陷阵，多立战功以外，在抚民理政、处置纠纷等方面，表现出优柔寡断，措置失当，甚至不能公平处理。
于是努尔哈赤感到很不得力，尤其在某些重大问题的决策上，代善与努尔哈赤的观点相悖，父子俩往往争执得相当厉害。
一年前，褚英被处死的诸多原因中，有一个重要的原因，就是他反对努尔哈赤的积极主战，到处用兵的思想，主张停战休兵，过安定和平的日子。
代善也主张弃战讲和，反对努尔哈赤树敌过多的做法。
代善曾当面劝说他的汗父努尔哈赤说：“既然要与明朝争天下，就应该集中力量，对付当面之敌；对背后的朝鲜王国，应该尽力讲和，以解除后顾之忧，又避免了前后受敌。”
努尔哈赤不以为然，他说：“朝鲜王国与明朝关系深厚，和谈解决不了问题。必须用武力去征服朝鲜，才能割断它与明朝的关系。”
于是，父子俩各持一端，争执不休。
萨尔浒大战以后，代善在东部战场上，与朝鲜王国的都元帅——姜宏立等，对天盟誓说：后金与朝鲜将永结盟好，两国间永不用兵，在后金与明朝发生冲突时，朝鲜王国不再出兵援助明朝等。
之后，代善将朝鲜的兵、将全部带到国都赫图阿拉。
当时，姜宏立、金景瑞两个元帅，因为拜见努尔哈赤时，只“行揖”而不跪。努尔哈赤大为震怒，扬言要杀他们。
代善当即向汗父建议说：“俺已代表大金国，与他们对天盟誓，汗父要杀他们，这是背天不义的行为。恳望汗王信守盟约，不以小节为意。”
听了代善的言辞，努尔哈赤无可奈何，只得答应他的请求。
后来，发生了朝鲜士卒强奸女真妇女的事件。努尔哈赤又想借故杀害朝鲜的士卒，代善知道后，赶忙又向汗父劝说道：“俗话说：一人做事一人当。谁犯了罪，就罚谁，杀谁，不能殃及无辜。”
努尔哈赤置之不理，竟下令一下子杀死四五百名朝鲜士卒。
以后代善得知这一消息，十分气愤地说：“俺悔不该在盟誓之后，将朝鲜兵、将带到国都来。早知如此，就送他们出国界了。”
天启元年初，努尔哈赤在攻占开原、铁岭之后，又经过大半年的备战，及时召开军事会议。讨论的中心议题，是进军辽、沈，还是攻打朝鲜王国之后，再回过头来打辽、沈？
会上，争论激烈。四贝勒皇太极首先说：“朝鲜王国历来是站在明朝一边，帮助明朝对付大金。先攻打朝鲜，等于打掉明朝的一个帮手，削弱了明朝的力量。”
莽古尔泰支持皇太极的意见，他说：“朝鲜王国仅是弹丸之地，兵力又少，易于攻取。截断朝鲜王国与明朝的关系，咱攻打沈、辽时，也解除了后顾之忧。”
大贝勒代善持相反意见，他说：“咱攻打朝鲜，明朝必然去救，或是来袭击咱的国都。咱要受前后之敌的夹击，能打胜吗？不如先与朝鲜讲和，然后咱再攻打辽、沈，岂不是两全其美么？”
扈尔汗支持代善的意见，他说：“俺以为，先把朝鲜王国的兵、将都放回去，与他们讲和，再攻打明朝的辽、沈，这是万无一失的策略。”
皇太极当即反对说：“放不放朝鲜王国的官兵，要看朝鲜王国的态度。它不主动臣属俺后金国，仍然不能放回他们的官、兵。”
在两种意见各不相让的情况下，努尔哈赤采取折中的办法，决定先出兵辽、沈，攻
