与第二主力舰队的总和，主要就是8艘巡洋舰上的“梅杜沙”系统能够为主力舰提供更加强有力的保护。即便在反潜方面，第三主力舰队也不会比第一主力舰队或者第二主力舰队差，因为第三主力舰队更加重要，所以还应该稍微强一点。
毫无疑问，这支刚才成军的舰队绝对是主力中的主力。
与之相比，航空舰队也是面貌一新。
所谓的航空舰队，实际上就是之前的第三航空舰队。因为在诺福苏海战后，海军决定为每个战区配备一支航空舰队，所以对舰队的名称做了调整，这里的航空舰队，全称应该是“太平洋战区航空舰队”。
与之前相比，航空舰队的最大区别就是用3艘“重庆”级替换了2艘“上海”级，使得舰队里的航母数量由4艘增加到5艘，舰载战斗机的数量则增加到了600架，即整整一个战术航空队。而舰载战斗机的出动率更是提高了100％，做到在一个作战批次中最多能够出动450架战斗机！
当然，新补充的3艘“重庆”级航母，都是在大战期间建造的。
大战爆发前，受《斯德哥尔摩协议》限制，共和国海军没有建造更多的航母，只是在主力舰的制海能力得到证明之前，并没放弃新式航母的开发与设计工作。大战爆发后，共和国海军就以最快的速度下达了2个批次、总计18艘的航母订单。当然，这样的订单肯定不可能一下子完成。在雅浦海战之前，第一批订单的6艘“重庆”级均已开建，只是受模块产能限制，建造进度都不够理想。
主力舰的制海作战能力得到证明后，海军做出了优先确保主力舰建造工作的战略决定，航母的建造工作被放在了次要位置上（到2059年底甚至比不上巡洋舰与驱逐舰）。当时，正好有2艘在马里亚纳海战中遭到重创的“重庆”级航母需要进行大修，所以海军当机立断，将两艘还在船台上施工的“重庆”级航母拆除，用零部件来维修受创的航母。建造进度最慢的一艘则完全拆解，所有模块都留着备用，只有建造进度最快的3艘，也就是即将完成船台建造的3艘才被保留了下来，并且在2060年初完工，随即加入海军战斗序列。
与战前建造的3艘“重庆”级相比，这3艘“重庆”级的变动并不大，主要就是换上了性能更加先进的中央计算机（只有1艘完全按照舰队旗舰的标准建造，另外2艘都在舾装过程中省去了旗舰模块，只保留了增添旗舰模块的接口），使用强度更高的飞行甲板，以及更加合理的弹药输送通道。
这也是很好理解的事情，毕竟在大战中，优先保证的是产量。再说了，“重庆”级的性能不算落后，而且在第二批建造的时候，其主要缺点还没有暴露出来，加上为“秦”级开发的“梅杜沙”系统还没有得到实战检验，所以海军在这3艘“重庆”级的设计与建造上非常保守。
事实也证明，共和国海军这么做并没错。
作为航空舰队，首要用途就是作为战术航空队的海上活动平台，即躲在主力舰队的身后，用搭载的战斗机为主力舰队提供防空掩护。一般情况下，除了敌人会首先攻击冲锋陷阵的主力舰队之外，航空舰队还不会轻易进入敌人空中力量的打击范围，特别是战术航空兵的打击范围，也就没有必要过分担心航空舰队的安全。
看得出来，正是航空舰队的作战能力得到提高，共和国海军才将3支主力舰队编在一起，一同杀向瓦胡岛。如果航空舰队的最大出动能力仍然是300架，为了给主力舰队提供足够的空中掩护，共和国海军最多只会派出2支主力舰队。
很明显，如此一来，就算把第三主力舰队顶上去，共和国海军也没有兵力优势。
原因很简单，美国海军的第二代主力舰，即标准排水量同样超过10万吨，而且完全按照共和国海军的发展思路、即没有配备除大口径电磁炮以外的远程打击武器、也没有配备舰队区域防空系统的“长岛”级主力舰已经问世，在6月底就有8艘加入战斗序列，预计将在7月初到达太平洋。
按照军情局的说法，有足够的理由相信，“长岛”级上肯定有与“梅杜沙”系统相似的末段拦截系统，就算没有，“长岛”级的拦截能力都是“长滩”级的好几倍，战场生存能力比“长滩”级高得多，不然增加的几万吨排水量拿去做什么了？更重要的是，“长岛”级肯定具备更加强大的持续作战能力，甚至拥有次口径主炮，即配备了1000磅级电磁炮（这一点从“长岛”级的主炮配制方式就看得出来）。如此一来的话，还有理由相信，“长岛”级能够在不动用20
